Итоги голосования для комментария:
Илья
Собственно, из-за пресловутого призрака. Странной пока не изученной штуки, которую можно копировать лиш единожды (решение проблемы армии клонов), и которая постепенно изменяет все привнесенные программы.
Я не на столько хорошо знаю вселенную «Призрака в доспехах».
Единственным решением, я пока вижу то, что сам процесс копирования, уничтожает оригинал, а информацию созданную в процессе копирования, по ряду причин дублировать пока невозможно.
Условно — микромашины медленно заменяют человеческие нейроны и связи между ними, а потом переносят эту структуру в новый мозг. При этом коммуникация между роем и компьютером возможна не больше чем между обычным мозгом и компьютером. Машины полностью перестраивают себя, согласно функциям той клетки, которую они заменяют. Впихнуть в этого микробота что-то ещё просто нет возможности (либо готовьтесь получить мозг размером с дом, но по функционалу не лучше человеческого).

Но только по сути, мы получаем второй вариант с «металлическими головами». Ведь реального «копирования» у нас нет, мы не можем размножить копии. По сути у нас перенос.
Как идея — нормально, просто по факту, это второй вариант, к которому я и так тяготею.