Итоги голосования для комментария:
flannan
Вообще довольно забавные предположения, что там должна быть файлы, файловая система, заголовки и т.д.
Всё зависит от того, расшифровываем ли мы флешку инопланетян, которые совсем как люди, только с косметическими отличиями (тогда мы можем ожидать, что их решения по хранению информации мало отличаются от наших), либо по-настоящему чужных 3.14 мерных морских звёзд (которые в самом деле могут подойти к вопросу организации данных совершенно по-другому).

Но если сузить до «расшифровать NTFS абсолютно не зная спецификаций» — то это будет не такая уж простая задача.
Но решаемая, насколько я понимаю.