Итоги голосования для комментария:

Александр Виноградов

Про лист бумаги и Markdown — соглашусь. Лучшие инструменты обычно — самые простые.

И да, с интересом прочитал бы про git, а с ещё большим интересом — про связку git и Scrivener. В своё время к ним присматривался, но так и не дошли руки.